生物多样性，简单地说，就是生物及其生存环境的多样性；确切地说，生物多样性包括地球上所有的植物、动物和微生物及其所拥有的全部基因和各种各样的生态系统。包括物种多样性、遗传多样性和生态系统多样性。
生物种类的多样性是指一定区域内生物钟类（包括动物、植物、微生物）的丰富性，如我国已知鸟类就有1244种之多，被子植物有3000种，即物种水平的生物多样性及其变化。
基因的多样性是指物种的种内个体或种群间的基因变化，不同物种（兔和小麦）之间基因组成差别很大，同种生物如兔之间（有白的、黑的、灰的等）基因也有差别，每个物种都是一个独特的基因库。基因的多样性决定了生物种类的多样性；生物种类的多样性组成了不同的生态系统。
生态系统的多样性是指生物群落及其生态过程的多样性，以及生态系统的环境差异、生态过程变化的多样性等。
遗传（基因）多样性是指生物体内决定性状的遗传因子及其组合的多样性。物种多样性是生物多样性在物种上的表现形式，可分为区域物种多样性和群落物种（生态）多样性。生态系统多样性是指生物圈内生境、生物群落和生态过程的多样性。遗传（基因）多样性和物种多样性是生物多样性研究的基础，生态系统多样性是生物多样性研究的重点。