执业药师分数线全国不一样，其中“三区三州”单独划定。“三区三州”具体指四川（阿坝州、甘孜州、凉山州和乐山市峨边县、马边县及金口河区）、云南（迪庆州、怒江州）、青海（海北州、黄南州、海南州、果洛州、玉树州、海西州）、新疆（阿克苏地区、克孜勒苏柯尔克孜自治州、喀什地区、和田地区）、甘肃（甘南州、临夏州、天祝县）、西藏。
需强调的是通过“三区三州”合格线取得的证书只在“三区三州”有效，只有通过执业药师全国分数线的，其证书才全国有效。执业药师全国分数线为72分每科，在四个连续的考试年度内参加执业药师考试并全部合格的，由各省、自治区、直辖市人力资源社会保障部门颁发《执业药师职业资格证书》。该证书由人力资源社会保障部统一印制，药监局与人力资源社会保障部用印。