西南医科大学是一本院校还是二本院校，需要根据生源地的录取批次来看。西南医科大学在河南、海南、重庆、四川、贵州是本科一批招生录取，所以一般认为西南医科大学在这些省份是属于一本院校。西南医科大学在青海、甘肃、宁夏、内蒙古、陕西、湖南、湖北、广西、江西、福建、安徽、江苏、黑龙江、吉林、山西、河北省份是本科一批招生录取，所以一般认为西南医科大学在这些省份是属于二本院校。
补充材料：
西南医科大学（简称西南医大，Southwest Medical University）于1951年始建，坐落于四川省泸州市，是四川省教育厅直属的重点建设本科院校。该校是国家“973计划”承担高校、首批“临床医学硕士专业学位研究生培养模式改革试点高校”、临床医学专业综合改革试点高校，入选“卓越医生教育培养计划”、“卓越医生（中医）教育培养计划”、“四川2011计划”、“四川省卓越法律人才教育培养计划”、四川省“双一流”建设计划；是四川省免费定向医生培养的高等院校，川南高校联盟理事单位。学校于1959年更名为泸州医学专科学校；1978年升格为泸州医学院；1982年学校获得学士学位授予权；1993年学校经国务院学位委员会批准成为硕士学位授权单位；2015年12月14日，教育部正式批准学校更名为西南医科大学。